ninety-nine times out of a hundred とは？

文字通り解釈すると、１００回中９９回、つまり、「almostalways（ほとんどいつも）」という意味になります。

例）
Ninety-nine times out of a hundred, you can fix the problem by restarting the computer.
(Merrian Webster Learners Dictionaryより）

（ほとんど、コンピューターは再起動すれば直る）

Ninety-nine times out of a hundred, my wife beats me in a quarrel.
（口論になると、ほとんど毎回、妻が勝つ）